По его словам, "уголовное дело в отношении Михаила Ходорковского расследуется". Кроме того, в рамках "дела "ЮКОСа" возбуждаются новые дела", сказал Чайка, отметив, что часть уголовных дел рассматривается в судах. "Дело идет своим чередом", - резюмировал он. "Дело это очень сложное, многоэпизодное, по которому ряд лиц, которым предъявлены обвинения заочно, находятся за рубежом", - сказал Чайка, выразив сожаление, что "не решается вопрос об их экстрадиции".
По словам Чайки, за три-четыре последних месяца в рамках "дела "ЮКОСа" были возбуждены "еще несколько уголовных дел, в том числе менеджеров дочерних компаний - в Томске и других регионах".
В мае 2005 года Мещанский суд Москвы признал Ходорковского и бывшего руководителя МФО "МЕНАТЕП" Платона Лебедева виновными в уклонении от уплаты налогов и мошенничестве в крупном размере и приговорил к девяти годам лишения свободы с отбыванием наказания в колонии общего режима. 22 сентября Мосгорсуд подтвердил приговор, снизив при этом срок наказания до 8 лет. 15 октября Ходорковский был доставлен в исправительную колонию, которая находится в 550 километрах от Читы на окраине города Краснокаменск. Лебедев был отправлен в колонию №3 в поселке Харп ЯНАО.